取代基团对倍他环糊精包合的影响

2021-12-07 09:20:15 350

    有研究人员通过分子动力学(MD)模拟研究了蒽(ANT)在三种环糊精(即倍他环糊精、羟丙基倍他环糊精磺丁基倍他环糊精钠)中的包合行为。MD结果表明,ANT可以自发地进入这三种环糊精的空腔中。不同的是,与磺丁基倍他环糊精钠进行包合作用时,ANT只能从磺丁基倍他环糊精钠的宽边进入其空腔。然后,通过分析每种环糊精的葡萄糖单元的结构畸变,研究了取代基2-羟基丙基(HP)和磺化丁基(SBE)对环糊精结构的影响。

    结果发现,中性的倍他环糊精呈现出圆锥形结构,而HP或SBE基团的存在对结构的影响很大。由于取代基团的波动引起的葡萄糖单元的翻转,二级边缘会变窄。当ANT被包含在空腔内时,三个环糊精的空腔构象得到了一定程度的恢复。同时,取代基团沿空腔轴线延伸并与客体分子相互作用。

    通过分析每个环糊精和ANT之间的相互作用,发现取代基团扩大了疏水性空腔的体积。取代基团和葡萄糖单元都会对与客体分子的相互作用作出贡献。环糊精环的构象变化导致空腔的收缩,这可能使其与ANT分子紧密结合。