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环糊精与阿塔鲁伦之间的主客体相互作用

2022-01-07
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有科研人员通过分子对接和分子动力学(MDs)模拟方法研究了天然环糊精(CDs)和一些改性环糊精(羟丙基倍他环糊精磺丁基倍他环糊精钠甲基倍他环糊精)与阿塔鲁伦(Ataluren)之间的主客体相互作用。阿塔鲁伦是一种针对无义突变引起的疾病而设计的小分子药物,用于杜氏肌营养不良症(DMD)。

分子对接结果显示,甲基倍他环糊精(MBCD)与阿塔鲁伦的结合亲和力,阿尔法环糊精(ACD)的结合亲和力。根据MDs模拟结果显示,ACD羟丙基倍他环糊精(HPBCD)没有合适的空腔来封装阿塔鲁伦。相比之下,阿塔鲁伦可以被完全包合在倍他环糊精(BCD)、伽马环糊精(GCD)、磺丁基倍他环糊精钠SBECD)和MBCD中。此外,MDs结果显示,SBECD具有的构象灵活性,BCD在模拟时间内具有的构象稳定性。

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